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<title>Transcriptome</title>
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<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><span class="mw-page-title-main">Transcriptome</span></h1>
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<div id="mw-content-text" class="mw-body-content mw-content-ltr" lang="fr" dir="ltr"><div class="mw-content-ltr mw-parser-output" lang="fr" dir="ltr">
<p>Le <b>transcriptome</b> est l'ensemble des <a href="Acide_ribonucl%C3%A9ique" title="Acide ribonucléique">ARN</a> issus de la transcription du <a href="G%C3%A9nome" title="Génome">génome</a>. L'analyse transcriptomique peut caractériser le transcriptome d'un tissu particulier, d'un type cellulaire, ou comparer les transcriptomes entre différentes conditions expérimentales.
</p>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Caractérisation_du_transcriptome"><span id="Caract.C3.A9risation_du_transcriptome"></span>Caractérisation du transcriptome</h2></div>
<p>La caractérisation et la quantification du transcriptome dans un tissu donné et dans des conditions données permettent d'identifier les <a href="G%C3%A8ne" title="Gène">gènes</a> actifs, de déterminer les mécanismes de régulation d'expression des gènes et de définir les réseaux d'expression des gènes (<a href="R%C3%A9seaux_de_co-expression_de_g%C3%A8nes" title="Réseaux de co-expression de gènes">Réseaux de co-expression de gènes</a>).
</p>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Outils_d'analyse"><span id="Outils_d.27analyse"></span>Outils d'analyse</h2></div>
<p>Les techniques couramment utilisées pour mesurer simultanément la concentration d'un grand nombre de types différents d'ARN messagers incluent les <a href="Biopuce" class="mw-redirect" title="Biopuce">puces à ADN</a>, le CAGE(en), le <a href="Analyse_en_s%C3%A9rie_de_l'expression_des_g%C3%A8nes" title="Analyse en série de l'expression des gènes">SAGE</a> et, plus récemment, le séquençage d'ARN à haut débit dit <a href="RNA-Seq" class="mw-redirect" title="RNA-Seq">RNA-Seq</a>.
</p>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Après_la_mort"><span id="Apr.C3.A8s_la_mort"></span>Après la mort</h2></div>
<p>Dans les 48 h qui suivent la mort, une partie des gènes continuent à s'exprimer ou s'expriment à nouveau pour des gènes qui étaient inhibés depuis la fin de la vie fœtale. On parle alors de <a href="Thanatotranscriptome" title="Thanatotranscriptome">thanatotranscriptome</a> ou dans le cas plus spécifique de l'apoptose de <span class="citation">« <a href="Thanatotranscriptome" title="Thanatotranscriptome">thanatotranscriptome</a> <a href="Apoptose" title="Apoptose">apoptotique</a> »</span><sup id="cite_ref-1" class="reference"><a href="#cite_note-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>
</p>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Notes_et_références"><span id="Notes_et_r.C3.A9f.C3.A9rences"></span>Notes et références</h2></div>
<div class="references-small decimal" style=""><div class="mw-references-wrap"><ol class="references">
<li id="cite_note-1"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-1">↑</a> </span><span class="reference-text">Javan, G. T., Can, I., Finley, S. J., & Soni, S. (2015). The apoptotic thanatotranscriptome associated with the liver of cadavers. Forensic science, medicine, and pathology, 11(4), 509-516 (<a rel="nofollow" class="external text" href="https://link.springer.com/article/10.1007/s12024-015-9704-6">résumé</a>.</span>
</li>
</ol></div>
</div>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Voir_aussi">Voir aussi</h2></div>
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/* start https://fr.wikipedia.org/ */
.mw-parser-output .autres-projets>.titre{text-align:center;margin:0.2em 0}.mw-parser-output .autres-projets>ul{margin:0;padding:0}.mw-parser-output .autres-projets>ul>li{list-style:none;margin:0.2em 0;text-indent:0;padding-left:24px;min-height:20px;text-align:left;display:block}.mw-parser-output .autres-projets>ul>li>a{font-style:italic}@media(max-width:720px){.mw-parser-output .autres-projets{float:none}}
/* end https://fr.wikipedia.org/ */
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<div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Articles_connexes">Articles connexes</h3></div>
<ul><li><a href="Biologie_mol%C3%A9culaire" title="Biologie moléculaire">Biologie moléculaire</a></li>
<li><a href="Bio-informatique" title="Bio-informatique">Bio-informatique</a></li>
<li><a href="Genevestigator" title="Genevestigator">Genevestigator</a></li>
<li> Métatranscriptome(en)</li>
<li><a href="Thanatotranscriptome" title="Thanatotranscriptome">Thanatotranscriptome</a></li></ul>
<div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Liens_externes">Liens externes</h3></div>
<ul><li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://biochimej.univ-angers.fr/Page2/COURS/9ModulGenFoncVeg/5MethEtudGenFonc/5MethodeSAGE/1MethodSAGE.htm">Explication d'une technique d'analyse du transcriptome : SAGE</a></li>
<li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://tagc.univ-mrs.fr/tbrowser">TranscriptomeBrowser: un logiciel pour la fouille de données de transcriptome</a></li>
<li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.ifr125.fr">Informations sur la plateforme TRANSCRIPTOME de Marseille, Timone, sur le site de l’Institut de Physiopathologie Humaine de Marseille </a></li>
<li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://biopuces.genotoul.fr/fr/sommaire.php">Plateforme Biopuces</a> de la <a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.genotoul.fr/">Génopole de Toulouse</a></li>
<li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://math.univ-toulouse.fr/biostat">Plateforme Biostatistique</a> de la <a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.genotoul.fr/">Génopole de Toulouse</a></li></ul>
<div class="navbox-container" style="clear:both;">
</div>
<ul id="bandeau-portail" class="bandeau-portail"><li><span class="bandeau-portail-element"><span class="bandeau-portail-icone"><span class="noviewer" typeof="mw:File"></span></span> <span class="bandeau-portail-texte">Portail de la biologie cellulaire et moléculaire</span> </span></li> </ul></div><!--htdig_noindex--><div><div class="zim-footer">
Cet article est issu de <a class="external text" title="Dernière modification le 2023-11-02" href="https://fr.wikipedia.org/wiki/?title=Transcriptome&oldid=209261225">Wikipédia</a>. Sauf mention contraire, le texte est disponible sous <a class="external text" href="https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/deed.fr">Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0</a>. Des conditions supplémentaires peuvent s’appliquer aux fichiers multimédias.
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